Para el gobierno de todo el territorio, el Patriarcado Latino de Jerusalén está estructurado en 71 parroquias (en 2019) agrupadas en 6 vicariatos territoriales:
1. Palestina vicariato patriarcal de Jerusalén y Palestina
2. Vicariato patriarcal de Israel de Israel, con sede en Nazaret
3. Vicariato Patriarcal de Jordania de Jordania, con sede en Ammán
La ciudad de Jerusalén
Su Excelencia Monseñor William Shomali, Vicario General y Patriarca para Jerusalén y Palestina
Su Excelencia Monseñor Jamal Daibes, Vicario General y Patriarca para Jordania 
Ordenación Episcopal de SE Monseñor Jamal Daibes
1. Palestina vicariato patriarcal de Jerusalén y Palestina, con sede en la curia patriarcal y jurisdicción sobre Palestina. El vicario patriarcal es el obispo auxiliar William Hanna Shomali, obispo titular de Lidda.
2. Vicariato patriarcal de Israel de Israel, con sede en Nazaret. El vicario patriarcal es el obispo auxiliar Rafic Nahra.
3. Vicariato Patriarcal de Jordania de Jordania, con sede en Ammán. El vicario patriarcal es el obispo auxiliar Jamal Khader.
4. Vicariato Patriarcal de Chipre de Chipre, con sede en Nicosia y jurisdicción sobre toda la isla de Chipre. El vicario patriarcal es el sacerdote Bruno Barriano, O.F.M.
5. Vicariato patriarcal de Santiago de Israel para católicos de habla hebrea en Israel, con sede en Jerusalén. El vicario patriarcal es el sacerdote Piotr Zelasko.
6. Vicariato patriarcal de Israel para inmigrantes y solicitantes de asilo en Israel, con sede en Jerusalén. El vicario patriarcal es el monje Nikodemus Schnabel, O.S.B.
